Le Programme de surveillance de la zone Atlantique (AZMP) a été mis en œuvre en 1998 dans le but de détecter et de suivre les changements et la variabilité climatiques dans l'Atlantique Nord-Ouest, d'évaluer les changements dans les propriétés physiques, chimiques et biologiques des océans et la dynamique prédateur-proie des ressources marines, améliorant ainsi la capacité du Canada à comprendre, décrire et prévoir l'état de l'écosystème marin. Le plan d'échantillonnage de l'AZMP dans la région des Maritimes comprend un échantillonnage océanographique dans deux stations côtières fixes à haute fréquence (bihebdomadaire à mensuelle), un échantillonnage semestriel à des emplacements aléatoires stratifiés lors des relevés au chalut écosystémique menés par le MPO, un échantillonnage semestriel le long de sections transversales fixes du plateau (ligne du détroit de Cabot, ligne Louisbourg, ligne Halifax, ligne Browns Bank et canal nord-est) ; ce dernier volet peut également inclure un échantillonnage opportuniste dans des stations situées dans les Laurentides Manche, golfe du Maine et diverses aires marines protégées (ZPM) à l'appui des activités auxiliaires programmes et initiatives de recherche.
Les données recueillies sont synthétisées dans deux rapports annuels sur les changements physiques et chimiques/biologiques dans la région des Maritimes et sont également utilisées pour évaluer les changements dans la zone atlantique.